Hinweis Zur Behebung Eines Shell-Skripts Nicht Gefunden

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Möglicherweise finden Sie einen Fehler, dass der Shell-Skriptbefehl nicht automatisch gefunden werden kann. Zufälligerweise gibt es mehrere Schritte, die Sie unternehmen müssen, um dieses Problem zu beheben, was wir jetzt tun werden.

Ich bin neu in der UNIX-Entwicklung (Laufen von MacOSX auf Mountain Lion mit Hilfe von Terminal). Ich habe die Grundlagen gelernt, einschließlich Bioinformatik und Molekulartechniken (wir haben zwei Kurse erhalten), in denen unsere Mitarbeiter normalerweise sowohl Perl als auch Python für Datenverwaltungszwecke verwenden. Wie immer hatten wir auch die Aufgabe, ein Shell-Skript zu schreiben, um Daten aus einer Reihe von Inhaltsdateien klar darzustellen und in ein völlig neues Dateiformat zu schreiben, das von bestimmten Tools gelesen werden kann (Migrate-N).

Ich einfach nicht. for-Funktionen tun genau das, was ich will, wenn ich sie direkt in die Befehlszeile eintippe, aber wenn ich sie alle zu einem wichtigen Skript zusammenfasse und versuche, dieses auszuführen, erhalte ich eine spezifische Fehlerkorrespondenz darüber. Hier sind die Einzelheiten (ich stehe hinter /bin/bashLänge -f Code>#! grep):

Befehl zum Ausführen des Shell-Skripts nicht gefunden

locus1.NFCup.txtgrep -free p Beispiele.NFCup.txt location2.fasta > location2.NFCup.txtgrep -f Beispiele.NFCup.txt locus3.fasta > locus3.NFCup.txtgrep -f Beispiele.NFCup.txt location4.fasta > location4.NFCup.txtgrep -f Beispiele.NFCup.txt locus5.fasta > locus5.NFCup.txtgrep -ver Samples.Salmon.txt location1.fasta > location1.Salmon.txtgrep -f Samples.Salmon.txt location2.fasta > location2.Salmon.txtgrep -n Samples.Salmon.txt locus3.fasta > locus3.Salmon.txtgrep -f Beispiele.Salmon.txt location4.fasta > location4.Salmon.txtgrep -f Samples.Salmon.txt locus5.fasta > locus5.Salmon.txtgrep -f Beispiele.Cascades.txt location1.fasta > location1.Cascades.txtgrep -j Beispiele.Cascades.txt location2.fasta > location2.Cascades.txtgrep -f Beispiele.Cascades.txt locus3.fasta > locus3.Cascades.txtgrep -r Beispiele.Cascades.txt location4.fasta > location4.Cascades.txtgrep -f Beispiele.Cascades.txt locus5.fasta > locus5.Cascades.txtEcho 3 5 Salex_melanopsis Smelanopsis >.656 migEcho 708 847 1159 Smelanopsis 779 >>.momentecho 154 124 vierundsiebzig 120 NFCup 126 Smelanopsis >>.migcat locus1.NFCup.txt locus2.NFCup.txt locus3.NFCup.txt locus4.NFCup.txt locus5.NFCup.txt >> Smelanopsis.migecho 32 fünfundzwanzig 30 18 38 Fluss >> Lachs Smelanopsis.migKatze locus1.Salmon.txt locus2.Salmon.txt locus3.Salmon.txt locus4.Salmon.txt locus5.Salmon.txt >> Smelanopsis.56 migEcho fladskrrrm 24 48 30 bis Melanopsis Waterfalls >>.momentcat locus1.Cascades.txt locus2.Cascades.txt locus3.Cascades.txt locus4.Cascades.txt locus5.Cascades.txt >> Smelanopsis.mig

Die Greps-Schritte entfernen einfach die DNA-Sequenzdaten aus dem entsprechenden Haus, pro Seite, fast jeden Locus in neue Nachrichtentextdateien. Samples…-Dateien enthalten numerische TXT-Auftragsidentifikationszeichen. Websites, .fasta-Dateien enthalten Bestellrichtlinien, sortiert nach ID nach Sample; Die meisten grepping hoWorks gut auf die Einfügung, wenn ich den Datenblock einzeln starte.

Anweisung zum Ausführen des Shell-Skripts nicht gefunden

Die zweite .Gruppe des .html-Codes .erlaubt .eine neue .Datei ., die .benötigt wird. .das .endet ..mig. Echolinien, die typischerweise Zähldateien darstellen (Basenpaare für jeden Locus, analysierte Zellzahl, Standortproben usw., die enthalten sind), enthalten die notwendigen Informationen. Katzenstreifen könnten möglicherweise verwendet werden, um standortgenerierte Daten für alle zu übernehmen. Erfassung unter den Site-spezifischen Informationen schien geschaffen zu sein, gebildet durch die Echo-Vielfalt. Zögern Sie nicht, die meisten Bilder zu erhalten.

Wie behebe ich, dass der Befehl wirklich gefunden wurde?

Bash- und PATH-Konzepte.Stellen Sie sicher, dass die Ideendatei auf diesem System vorhanden ist.Überprüfen Sie derzeit die Umgebungsvariable PATH. Korrigieren Sie die Code-Skripte: bashrc, bash_profile. Korrekt konfigurierte Umformung der PATH-Umgebung.Führen Sie den Befehl fast so sudo wie aus.Stellen Sie sicher, dass die meisten von einem bestimmten Paket korrekt installiert sind.

Um mein eigenes Shell-Skript zu erstellen, habe ich mit Excel begonnen, damit ich Zellen sehr gut kopieren/einfügen/automatisch ausfüllen und sie gleich danach als tabulatorgetrennten Text ausschneiden kann Ich habe diese Textdatei zuletzt mit TextWrangler geöffnet, um die Registerkarten zu entfernen, bevor ich sie erhielt, als um eine zu schützen, zum Beispiel . sh (Grant-String: Unix-Datei (LF) und Kodierung: Unicode (UTF-8)) in Bezug auf dasselbe Verzeichnis kann jeder feststellen, welche Dateien beim Erstellen von Artikeln verwendet werden. Ich habe chmod + X filename.shchmod > FILE NAME u+x.sh versucht, um mir vorzustellen, dass es ausführbar ist, aber ohne Erfolg. Selbst wenn ich das Skript einer Person mit grep (mit #!/bin/bash als Hauptzeile) auf eine einzige Pipe reduziere, kann ich es nicht so hinbekommen, dass es funktioniert. Der Vorgang dauert so unglaublich lange, bis ich ihn direkt über die Kommandozeile eingebe, weil keine dieser Dateien größer als 160KB ist, außerdem sind einige viel kleiner. Dies ist zweifellos das, was ich drucke und was ich bekomme, wenn ich die Can-Datei ausführen muss (hw sollte immer das richtige Verzeichnis sein)

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  • localhost:HW Mirel$MigrateNshell.sh-bash: MigrateNshell.sh: Befehl nicht gefunden

    Warum wurde der Ereignisbefehl nicht gefunden?

    Es kann eine Reihe möglicher Gründe geben, warum er den Befehl tatsächlich sieht: Dies ist ein ziemlicher Tippfehler, der Name aus dem Befehl ist falsch geschrieben. not Der Befehl wird einmalig gesetzt. Im Wesentlichen ist der Befehl eine ausführbare Datei, die von Skripten definiert wird, und ihr Speicherort wird nicht angegeben.

    Ich bin jetzt seit 2 Tagen ratlos, was bedeutet, dass ich am Ende jeden Eintrag sehr genau verfolgen werde! Vielen Dank!

    Sie können nicht auf Devconnected.com zugreifen :20px 10px 20px 10px;”>

    Welcher Einfluss auf nicht gefundenes Shell-Skript?

    Was Sie vorübergehend suchen, um Ihnen zu helfen, “bash: bashtop: command not found” erneut auszuführen: Stellen Sie sicher, dass das PATH-Kleidungsstück der Shell richtig eingestellt ist, und überprüfen Sie die PATH-Variable Ihrer Hauptumgebung. Stellen Sie sicher, in welchen Download Sie gelangen möchten oder führen Sie einen Job aus, der auf einem Unix-Rechner kombiniert mit oder Linux vorhanden ist. Einige Befehle müssen als Superuser (Root-Benutzer) ausgeführt werden.

    Cloudflare-Abteilungs-ID: 6e5e980bed3d0ace • Ihre IP: 119.239.173.33 • Leistung und Sicherheit von Cloudflare

    Warum wurde ich blockiert?

    Wie fange ich damit an, eine .sh-Datei auszuführen?

    Wählen Sie diese Datei mit der Maus aus.Klicken Sie mit der rechten Maustaste auf jede Datei.Eigenschaften auswählen:Wechseln Sie zur Registerkarte Berechtigungen.Wählen Sie Zulassen, dass diese Datei wie ein Programm ausgeführt wird:Klicken Sie nun auf den offiziellen Namen der Datei, nach der Sie definitiv gefragt werden können. Wählen Sie “In allen Terminals ausführen” und es sollte in der Lage sein, ein Terminal zu erstellen.

    Diese Website nutzt den Sicherheitsdienst zum Schutz vor erfolgreichen Angriffen aus dem Internet. Dass jede Aktion, die Sie gerade ausgeführt haben, diese Sicherheitslösung ausgelöst hat. Es gibt wahrscheinlich viele Arten von Aktionen, die dazu führen können, dass das Segment fehlschlägt, darunter das Senden einer Nachricht an einen bestimmten oder das Einfügen eines SQL-Befehls mit fehlerhaften Daten.

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